Die Heldin Æon Flux lebt in der Stadt Monica, der Nachbarstadt von Bregna. Als Auftragskillerin, Geheimagentin und Terroristin geht sie häufiger über die Grenze und erledigt Mordaufträge. Ihr ständig wiederkehrender Erz-Feind ist Trevor Goodchild, der Herrscher der Stadt Bregna und ihr Liebhaber.