Tras la muerte de su madre, la pequeña Nanami Simpson acompaña siempre a su padre, que es biólogo marino. Viajan en un pequeño barco, el Peperonchino, en busca de un tipo de ballena llamada "ballena luminosa". Cuando se encuentran con los restos de esta especie, decepcionado, cambia su misión. Ahora trabajará para el cuidado y la preservación de estas criaturas. Nanami se hace amiga de una orca a la que llama Tico. Juntos viajan a través de los mares, descubriendo sus maravillas y disfrutando de ellas. Con el tiempo, Nanami incluso aprende a respirar bajo las aguas, lo que sorprende a su padre. Sin embargo, un día su vida corre peligro...