Flapjack es un niño criado por una ballena parlante llamada Bubbie, ambos llevan una vida tranquila hasta que deben rescatar a un pirata llamado Capitán Muñón y él le cuenta a Flapjack sobre la Isla Dulce. Inspirados por el pirata, Flapjack y Bubbie se meten en extraños problemas y desventuras en busca de Candied Island. Estos tres personajes pasan la mayoría de su tiempo en Puerto Borrascoso, donde consumen golosinas, buscan aventuras y se meten en lios.