Le gouverneur Asakura, réélu comme Gouverneur de Tokyo, reçoit une mystérieuse lettre de menace. Le lendemain, le tunnel de la nouvelle ligne de métro qui doit être inaugurée, explose. Conan en entend parler par Kogoro, et arrive à prévenir les passagers du métro. Alors que la police a beaucoup de mal à trouver un suspect, une autre construction initiée par Asakura est menacée...