Minus et Cortex, ces deux souris de laboratoire génétiquement modifiées, sont sans abri depuis que les laboratoires Acme ont disparu. Et les souris ont besoin d'un endroit où se cacher car une organisation secrète veut appréhender Cortex. Alors qu'elles se cachaient dans une animalerie, les souris ont été achetées par Elmyra Duff. Les souris sont désormais obligées d'opérer depuis la maison d'Elmyra et de subir ses méthodes tordues pour s'occuper des animaux. Malgré toutes ces nouvelles complications, Minus et Cortex continuent d'essayer de conquérir le monde.