Po powrocie pułkownika O'Neilla z misji na Abydos, Gwiezdne Wrota zostały wyłączone i przechowywane były w bazie Cheyenne. Rok później Wrota aktywowały się i wyszła z nich grupa obcych zwanych Goa'uldami, która napadła na bazę. Jej dowódca, gen. Hammond poprosił pułkownika O'Neilla o powrót do służby i pomoc w poprowadzeniu kolejnej misji na Abydos. Na miejscu ekipa z Ziemi spotkała doktora Jacksona, który został na planecie po pierwszej wyprawie. Odkrył on, że w galaktyce istnieje cała sieć Gwiezdnych Wrót. Oznaczało to, że skoro obcy nie przyszli z Abydos mogli wrócić na którykolwiek z tysięcy adresów. Kolejny atak obcych, tym razem na mieszkańców Abydos umożliwił Ziemianom odnalezienie i uratowanie porwanych. Na planecie Chulak zdobyli uznanie jednego z obcych - Teal'ca, który postanawia się do nich przyłączyć. Wtedy w bazie Cheyenne zostaje utworzone dowództwo Gwiezdnych Wrót - SGC. Kilkanaście drużyn SG - w tym SG-1 w składzie: pułkownik Jack O'Neill, kapitan Samantha Carter, doktor Daniel Jackson i Teal'c, podróżują przez Wrota badając inne światy i technologie, które umożliwią im walkę ze złymi Goa'uldami. Przez 8 sezonów serialu Ziemianie i ich sprzymierzeńcy (m.in. Asgard) walczą z Goa'uldami (i innymi zagrożeniami, np. Replikatorami), aż do obalenia ich władzy nad galaktyką. W 9 sezonie pojawia się jednak nowy wróg - zły odłam Pradawnych, nazywający się Ori. Chcą oni nawrócić wszystkich w naszej galaktyce na ich wiarę, podając się za jedynych, prawdziwych bogów. Światy galaktyki mają wybór - albo będą czcić Ori, albo zostaną zniszczone. SGC szuka sposobów do walki z kapłanami Ori, jednocześnie próbując przekonać mniej rozwinięte planety, że moc Ori nie pochodzi z boskiej magii, lecz z technologii.