Leonardo, Rafael, Donatelo e Miguel Ângelo surgiram dos esgotos de Nova Iorque para combater o mal. Após uma mutação gráfica, constituem agora uma verdadeira ameaça para todos os inimigos e malfeitores que se atravessarem no seu caminho. Sob o comando do mestre Splinter, as Tartarugas Ninja continuam a devorar pizza, a praticar a arte marcial milenar Ninjitsu, a viver nos canais de esgoto da Big Apple, e a conservar o seu fantástico sentido de humor, altamente contagioso.