En 2116, le Japon a commencé à exporter le dispositif "Psycho-Pass" dans le monde entier. L'union d'Asie du Sud Est expérimente ainsi le système alors que le reste du pays s'enfonce dans la guerre civile. L'intrusion de terroristes de l'U.A.S.E au Japon va amener l'inspecteur Akane Tsunemori et son équipe à mener leur enquête.