Bohaterem tego serialu jest niebieski jeż - superbohater Sonic. Od dawna toczy on zaciętą walkę z przebiegłym Dr Eggmanem. Ten szalony naukowiec pragnie odszukać wszystkich siedem Szmaragdów Chaosu, aby za ich pomocą zdobyć władzę nad światem. W obronie szmaragdów pomagają Sonicowi jego przyjeciele: Tails - lisek o dwóch ogonach który potrafi latać, Amy - dziewczyna Sonica, będąca jeżem koloru różowego i Knuckles - czerwona kolczatka. Podczas decydującego pojedynku Centrum Chaosu Dr Eggmana eksploduje i Sonic X zostaje przeniesiony do Square City - do całkiem nowego dla siebie świata. Czy da sobie w nim radę? Czy odnajdzie w nim przyjaciół? Czy dogonią go tu wrogowie?